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控制科学与工程系教师

刘云

发布日期 :2023-05-30作者 :点击 :

姓名 刘云 民族

出生日期 1989年11月 工作单位 控制科学与工程系
党派 共产党员 专业 模式识别与智能系统
职称 副教授 任职时间 2021年10月
硕导/博导 硕士导师 聘任时间 2021年10月
行政职务
担任时间
办公电话
个人主页
电子信箱 liuyun313@jlu.edu.cn
主要学历:

2007.09-2011.06 韦德体育bevictor 自动化专业 工学学士

2011.09-2016.12 韦德体育bevictor 模式识别与智能系统 工学博士


主要学术经历:

2017.12-2021.09 韦德体育bevictor 讲师

2021.10-至今 韦德体育bevictor 副教授/硕士生导师

研究方向及主要研究内容介绍:

1.机器学习基础理论:面向高维多类不平衡数据的聚类算法及聚类有效性指标;面向异构数据的融合深度学习方法等。

2.宏基因组数据处理:宏基因组序列高精度聚类;从宏基因组中挖掘疾病相关等生物标记物,以及生物合成基因簇、抗菌肽等功能序列;面向宏基因组的蛋白质亚细胞定位预测方法等。

兼职情况:


中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员

iMeta期刊青年编委

Pattern Recognition、Bioinformatics、Neurocomputing、Signal Processing、Bioinformatics Advances、iMETA等SCI期刊审稿人


承担的教学任务及授课对象:

机器人操作系统与软件工程 本科

python语言程序设计 本科

大数据与数据挖掘 本科


培养研究生情况:


在读硕士3人。


承担过的主要科研项目:

1.中国博士后科学基金面上项目(2019M651204),基于无监督深度学习的肠道宏基因组低丰度物种挖掘算法,2019.5-2020.11,负责人

2.吉林省科学技术协会,第五批吉林省青年科技人才托举工程(QT202109),2021.4-2023.12,负责人

3.吉林省教育厅科学技术研究规划项目,基于深度学习的微生物组蛋白质亚细胞定位预测方法研究(JJKH20221008KJ),2022.01-2023.12,负责人

4.吉林省自然科学基金,融合Hi-C测序数据的单宏基因组DNA序列聚类方法研究(20230101064JC),2023.01-2025.12,负责人

5.国家自然科学基金(青年),面向宏基因组的蛋白质亚细胞定位预测方法研究(62303193),2024.01-2026.12,负责人

获得主要科研成果:


以第一/通信作者发表的主要论文:

[1] Fu Liu, Jingyuan Wang, Yun Liu*. IMI2: A Fuzzy Clustering Validity Index for Multiple Imbalanced Clusters [J]. Expert Systems With Applications, 2024, 238: 122231. (IF=8.5,中科院1区)

[2] Yun Liu, Yanfang Jiang, Tao Hou, Fu Liu*. A new robust fuzzy clustering validity index for imbalanced data sets [J]. Information Sciences, 2021, 547(8): 579-591. (IF=8.233, 中科院1区)

[3] Yan Miao, Fu Liu, Tao Hou, Yun Liu*. Virtifier: A deep learning-based identifier for viral sequences from metagenomes [J]. Bioinformatics, 2022, 38 (5): 1216-1222. (IF=6.931)

[4] Fu Liu, Yan Miao, Yun Liu*, Tao Hou. RNN-VirSeeker: a deep learning method for identification of short viral sequences from metagenomes [J]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, 19 (3): 1840-1849.

[5] Qiaoliang Liu, Fu Liu, Yan M, Jiaxue He, Tian Dong, Tao Hou, Yun Liu*. virSearcher: Identifying Bacteriophages from Metagenomes by Combining Convolutional Neural Network and Gene Information [J]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023, 20(1): 763-774.

[6] Liu Yun, Hou Tao, Kang Bing, Liu Fu*. Unsupervised Binning of Metagenomic Assembled Contigs Using Improved Fuzzy C-Means Method [J]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2017, 14(6): 1459-1467.

[7] Yun Liu, Tao Hou, Yan Miao, Meihe Liu, Fu Liu*. IM-c-means: A new clustering algorithm for clusters with skewed distributions [J]. Pattern Analysis and Applications, 2021, 24(2): 611-623.

[8] Liu Yun, Hou Tao, Liu Fu*. Improving fuzzy c-means method for unbalanced dataset [J]. Electronics Letters, 2015, 51(23): 1880-1881.

[9] Fu Liu, Tian Dong, Yun Liu*. An Improved Informer Model for Short-Term Load Forecasting by Considering Periodic Property of Load Profiles [J]. Frontiers in Energy Research, 2022.08, 10: 950912.

[10] Yun Liu, Fu Liu, Xintong Hu, Jiaxue He, Yanfang Jiang*. Combining Genetic Mutation and Expression Profiles Identifies novel prognostic biomarkers of Lung Adenocarcinoma [J]. Clinical Medicine Insights: Oncology, 2020, 14: 1-10.





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